Верхоянский хребет состоит из десятков хребтов со среднегорным (хребет Орулган) и низкогорным (хребты Кулар и Хараулах) рельефом. Гребень хребта пересекают глубокие ущелья рек бассейна Лены.
Является водоразделом бассейнов Лены и Алдана с западной стороны хребта и Омолоя, Яны и Индигирки с восточной.
На Верхоянском хребте берут начало реки: Менкере, Соболох-Маян, Ундюлюнг, Дянышка, Томпо, Бытантай, Дулгалах, Сартанг, Нельсере и др.
Высшая точка Верхоянского хребта, расположенная в горной системе хребта Орулган, — безымянная отметка 2409 м. Она находится примерно в 125 км от села Батагай-Алыта, вверх по долине реки Улахан-Саккырыр и её притоку Тара-Сала (лист Q-52-III,IV).